日前，中國(guó)地質(zhì)科學(xué)院水環(huán)所經(jīng)過積極探索，反復(fù)試驗(yàn)，建立了適合土樣和地下水樣的微生物分子生物學(xué)檢測(cè)高新技術(shù)。
土壤微生物檢測(cè)技術(shù)通過對(duì)不同樣品微生物DNA的提取，將提取的DNA進(jìn)行擴(kuò)增并識(shí)別，來確定樣品中微生物的多樣性和種屬，具有性和準(zhǔn)確性，免去了煩瑣、需時(shí)長(zhǎng)的培養(yǎng)過程，可檢出傳統(tǒng)方法不可培養(yǎng)的微生物，并能原位反映微生物群落結(jié)構(gòu)的真實(shí)情況。微生物分子生物學(xué)技術(shù)的建立，突破了長(zhǎng)期以來一直采用的傳統(tǒng)微生物培養(yǎng)技術(shù)方法。該技術(shù)在污染修復(fù)、成巖成礦成油機(jī)理研究、微生物找礦、污水處理等方面具有廣泛的應(yīng)用前景，是一種快速準(zhǔn)確的高新技術(shù)。
目前，傳統(tǒng)的微生物培養(yǎng)方法只能檢測(cè)少量可培養(yǎng)的微生物，不能揭示其余大量的微生物，以至對(duì)水土環(huán)境中微生物的多樣性認(rèn)識(shí)以偏概全。近年來，通過直接對(duì)樣品的DNA分析揭示其微生物種類的技術(shù)得到了較大發(fā)展，該技術(shù)可不通過對(duì)微生物進(jìn)行培養(yǎng)的方法，更快速、準(zhǔn)確地反映微生物種群的多樣性，為研究水土環(huán)境中的微生物組成開辟了一條嶄新的道路。通過對(duì)水土樣品DNA提取純化，利用聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)（PCR）技術(shù)，對(duì)樣品DNA進(jìn)行擴(kuò)增，對(duì)擴(kuò)增后的產(chǎn)物再利用變性梯度凝膠電泳（DGGE）技術(shù)，將不同微生物類型的DNA基因片段分離，直觀顯示樣品中微生物群落的多樣性。還可將DGGE技術(shù)的產(chǎn)物再擴(kuò)增，然后測(cè)序，準(zhǔn)確鑒定微生物種屬。從樣品DNA提取純化，到PCR擴(kuò)增，再到DGGE分離和測(cè)序，構(gòu)成了一整套水土環(huán)境中微生物組成多樣性和種屬鑒定研究的分子生物學(xué)檢測(cè)技術(shù)。
土壤微生物檢測(cè)技術(shù)的建立，突破了長(zhǎng)期以來一直采用的傳統(tǒng)微生物培養(yǎng)技術(shù)方法，可以更加直觀全面地將樣品的多樣性展示出來，以及準(zhǔn)確鑒定微生物種屬。它不僅可以應(yīng)用于科學(xué)研究，在具體的實(shí)踐工作中也具有很好的應(yīng)用前景：可顯示在污染環(huán)境修復(fù)過程中，是哪類微生物大量繁殖并修復(fù)污染，這類微生物就可人工添加至類似污染環(huán)境，加速污染修復(fù)過程。同時(shí)，在成巖成礦成油的過程中，通過微生物參與技術(shù)，可以找到并鑒定相關(guān)的微生物種類，為成巖成礦成油機(jī)理研究以及利用微生物找礦而建立一種快速有效的手段。
土壤微生物檢發(fā)展方向是快速，準(zhǔn)確，簡(jiǎn)便，自動(dòng)化，當(dāng)前很多生物制品公司利用傳統(tǒng)微生物檢測(cè)原理，結(jié)合不同的檢測(cè)方法，設(shè)計(jì)了形式各異的微生物檢測(cè)儀器設(shè)備，正逐步廣泛應(yīng)用于醫(yī)學(xué)微生物檢測(cè)和科學(xué)研究領(lǐng)域。例如：
1、土壤微生物檢測(cè)抗干擾培養(yǎng)基和微生物數(shù)量快速檢測(cè)技術(shù)結(jié)合解決了傳統(tǒng)微生物檢測(cè)手段不能解決的難題，為建立一套完整的抗干擾微生物檢測(cè)系統(tǒng)奠定了堅(jiān)實(shí)的基礎(chǔ)。
2、BACTOMETER 全自動(dòng)各類總菌數(shù)及快速細(xì)菌檢測(cè)系統(tǒng)可以數(shù)小時(shí)內(nèi)獲得監(jiān)測(cè)結(jié)果，樣本顏色及光學(xué)特征都不影響讀數(shù)，對(duì)酵母和霉菌檢測(cè)同樣高度敏感原理是利用電阻抗法將待測(cè)樣本與培養(yǎng)基置于反應(yīng)試劑盒內(nèi)，底部有一對(duì)不銹鋼電極，測(cè)定因微生物生長(zhǎng)而產(chǎn)生阻抗改變。如微生物生長(zhǎng)時(shí)可將培養(yǎng)基中的大分子營(yíng)養(yǎng)物經(jīng)代謝轉(zhuǎn)變?yōu)榛钴S小分子，電阻抗法可測(cè)試這種微弱變化，從而比傳統(tǒng)平板法更快速監(jiān)測(cè)微生物的存在及數(shù)量。測(cè)定項(xiàng)目包括總生菌數(shù)，酵母菌，大腸桿菌群，霉菌，乳酸菌，嗜熱菌，革蘭氏陰性菌，金黃色葡萄球菌等。